Windows環境でアプリケーション(Webアプリではなく、Formsアプリ)を作る場合、 最近ではC#を使うのが典型的となっているのではないかと思います。 必要に応じてC++やCで開発したDLLを呼び出したり、あるいはC#から直接DLLを呼び出すかもしれません。 マニアックな方であれば、C#ではなくてF#を使ったりするかもしれません。

業務上作成するアプリケーションはできる限りのパフォーマンスが欲しい、という要求が生じることがあります。 そうなると、現状ではC++/CLIでアプリケーションを作るのが最も良いのではないかと思います。

C++/CLIで実装すれば、WindowsのFormもグラフィカルデザイナーで作成できますし、 必要であれば.NETコードではなくてネイティブコードを生成するようコンパイラオプションで設定することもできます。 しかも.NETとネイティブコードとのデータのやり取りは、関数呼び出しで行う限りほぼ暗黙的に実行できます。

C++であればOpenMPもC++ AMPも自由自在です。そのため、GPGPUやマルチスレッドプログラムの作成も (APIを呼び出すことなく)比較的簡便に行うことができます。

個人的にはC++なんて醜悪言語は使いたくないですが、パフォーマンスのためには背に腹は代えられません。